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Jor Johansson
22:35 3. Apr.
 
Genehmiger
sp
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Neu
Maya Burke
18:37 4. Apr.

Genehmiger
Im Inhaltsverzeichnis hinzufügen: „i“
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Neu
Gerold Morrison
14:45 8. Apr.
 
Genehmiger
In addition to recent seagrass losses, the project scope of work also addresses
"recurring water quality issues leading to non-attainment of existing targets,
thresholds, and numeric nutrient criteria" and recurring HABs in OTB.  Those
issues should also be addressed in the Introduction and body of the report.
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Neu
Jor Johansson
22:44 3. Apr.
 
Genehmiger
Yes, but substantial losses of Sf have also occurred off Feather Sound and
Double Branch Creek; and both Sf and Tt have been lost in the western area
between the HFB and GB causeways.
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Neu
Jor Johansson
18:15 4. Apr.
 
Genehmiger
It should be noted that optical modeled attenuation coefficients using ambient
water quality parameters suggest that the management light targets may
overestimate light conditions present in these areas (see Johansson and JEI
2022).
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Maya Burke
17:45 3. Apr.
 
Genehmiger
worth including the distinction between management targets & reg. thresholds?
chl-a regulatory thresholds met 50%, 5/10 years
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Maya Burke
19:17 4. Apr.
 
Genehmiger
Maybe a better figure would be
from https://shiny.tbep.org/seagrasscoverage-dash/
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Gerold Morrison
20:05 3. Apr.
 
Genehmiger
Even with Ed's suggested change, there still appears to be a phrase or two
missing or misplaced here.
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Ed Sherwood
16:59 3. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "in the"
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Holly Greening
14:31 3. Apr.
 
Genehmiger
also the empirical model and the WASP mechanistic model indicated excess N
loading-  suggest including these and references associated with them.
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Neu
Marcus Beck
21:41 12. Apr.

Genehmiger
Löschen: "were not necessary to discern the nat during the when models, data,
and paradigms ure of the managem…"
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Neu
Holly Greening
14:31 3. Apr.
 
Genehmiger
See comment re: mechanistic and empirical models were used, and were
instrumental in developing the management paradigm.
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Ed Sherwood
17:04 3. Apr.

Genehmiger
See this TBEP white paper summary on the history of target setting when NNC were
being developed in the state (ca.
2010): https://docs.google.com/document/d/1sT_E2ao7ZhJZsrCyRWcrmxGAf_MpP_Nw/edit?usp=sharing&ouid=107198491532889175628&rtpof=true&sd=true
.

Additionally, the latest TBNMC declaration (Appendix "A") provides an update to
this history and can be viewed
here: https://drive.google.com/file/d/1fMfXhKWBWPG5R6FSLRuM2WNMhcrrJmeM/view?usp=drive_link
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1 Antwort
Neu
Holly Greening
14:31 3. Apr.
 
Genehmiger
Reference
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Marcus Beck
21:44 12. Apr.

Genehmiger
Could reference the TAC presentation from
Anastasiou https://drive.google.com/drive/folders/1-HWPf-NIHsTQv2hCADhb0hsPKQkzxvLG
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1 Antwort
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Jor Johansson
22:35 3. Apr.
 
Genehmiger
see Johansson and JEI 2022, and comment on page 7 "Light Availability"
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Neu
Holly Greening
14:31 3. Apr.
 
Genehmiger
would be helpful to include a graphic of the current simplistic management
paradigm here, to inform readers who may not be as familiar with it.
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Maya Burke
17:54 3. Apr.

Genehmiger
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Marcus Beck
21:46 12. Apr.

Genehmiger
https://github.com/tbep-tech/tbep-os-presentations/blob/master/figure/TBEP_N_Paradigm.png,
but it's also reimagined in Figure 3 below.
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2 Antworten
Neu
Maya Burke
17:57 3. Apr.
 
Genehmiger
This is one potential ecological end point. Another option might be to manage
for chl/habs, regardless of whether or not attaining a certain chl-a
concentration results in seagrass coverage gains.
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Maya Burke
18:01 3. Apr.

Genehmiger
This approach is very directly related to the regulatory thresholds; whereas
seagrass management corresponds more to the management paradigm and associated
chl-a + la targets
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Gerold Morrison
23:25 3. Apr.

Genehmiger
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Marcus Beck
21:45 12. Apr.

Genehmiger
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3 Antworten
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Marcus Beck
21:54 12. Apr.
 
Genehmiger
Seems worth making a more clear distinction between the ecological framework and
the management paradigm.  Figure 2 is a generalized understanding of the
ecosystem that OTBIEM attempts to model, whereas the nutrient management
paradigm is a simplistic but powerful depiction of the primary control
mechanisms for managing seagrass as only one pathway in the ecological
framework.
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Holly Greening
22:48 13. Apr.

Genehmiger
Agreed
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Maya Burke
20:58 21. März
 
Genehmiger
The current management paradigm is
simplistic: https://shiny.tbeptech.org/wq-dash/wq-dash_files/www/nitro.jpg
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Maya Burke
20:59 21. März

Genehmiger
We know that the system dynamics are much more complex, which is what the
ecological framework and OTBIEM try to simulate
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Marcus Beck
21:55 21. März

Genehmiger
this link works: https://github.com/tbep-tech/wq-dash/blob/master/www/nitro.jpg
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Holly Greening
14:31 3. Apr.
 
Genehmiger
What is the yellow shading?  Not explained in the text or figure legend.
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Ed Sherwood
17:17 3. Apr.

Genehmiger
The yellow shading indicate the primary pathways/ecological concerns that the
TBEP TAC identified (ca. 2009-2010) for focusing development of the original
"Integrated Model."
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1 Antwort
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Marcus Beck
21:54 12. Apr.

Genehmiger
Löschen: "(muck)"
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Holly Greening
14:31 3. Apr.
 
Genehmiger
Reference for saxitoxin impacts
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sugandha shankar
21:18 12. Apr.
 
Genehmiger
Are there studies discussing impacts of saxitoxins on seagrass?
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sugandha shankar
21:10 12. Apr.
 
Genehmiger
I don't believe this was the focus of work done in 2023. This was an additional
exercise tried at a preliminary level.
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sugandha shankar
21:12 12. Apr.
 
Genehmiger
the modeling attempt using Pyrodinium specific parameters were tried using some
values generated by FWRI, but parameters used were generated for Pyrodinium or
comparable dinoflagellates elsewhere. There aren't enough Pyrodinium specific
parameters available for Tampa Bay isolates.
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Ed Sherwood
17:19 3. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "Lopez et al. (2023) recommended additional research and modeling
applications to further refine or i…"
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Ed Sherwood
17:22 3. Apr.
 
Genehmiger
TBEP Tech. Pub.
12-23: https://drive.google.com/file/d/140oBnV5R2BwOZ7cMuaY-4bu_ftL-YBVJ/view
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Neu
Jor Johansson
22:39 3. Apr.
 
Genehmiger
Decomposing Pyrodinium also add color and turbidity to the water column and add
organic material to the sediments when settled.
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Neu
sugandha shankar
21:25 12. Apr.
 
Genehmiger
I believe RCA is modeling dinoflagellates, so, not just revisions, but
incorporation of Pyrodinium specific parameters is needed.
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Ed Sherwood
17:28 3. Apr.
 
Genehmiger
In much of the early (and contemporary) empirical and optical modelling work,
turbidity plays the most significant light attenuating factor in the Bay.
However, maintenance of chl-a levels was viewed as the most practical parameter
to pro-actively 'manage.'
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Neu
Gerold Morrison
20:22 3. Apr.
 
Genehmiger
Might want to add some text at the end of this section about possible
interactions between increasing temperature and SAV light requirements, given
the available information on Zostera (e.g., Moore et al. 2014 Chesapeake Bay
paper).
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Marcus Beck
21:58 12. Apr.

Genehmiger
Löschen: "HC"
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Neu
Marcus Beck
21:58 12. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "HC"
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Neu
Jor Johansson
20:22 4. Apr.
 
Genehmiger
Elevated chl c concentrations in OTB appear to coincide with elevated chl a
concentrations, further chl a/c ratios of median concentrations from EPC
stations during 2023 ranged between 5 and 8 and do not display any obvious
spatial pattern.

Also, an examination of chl a/c ratios from the 2023 EPC data base does not
suggest that OTB has unusually high ratios when compared to HB or MKB.

I can not find any discussion of chl c concentrations in Johansson and JEI 2015.

Also, it is uncertain that the added absorption of usable radiation by the
relatively low concentration of the accessory pigment chl c, would be a primary
cause of the sudden and extensive seagrass loss that occurred along transects of
the OTBN and OTBCW from 2018 to 2021. Hw was lost in both shallow near shore
areas and deep areas; and Sf was primarily lost at deeper locations (see TBEP
transect information
https://shiny.tbep.org/seagrasstransect-dash/?_gl=1*bj2h6n*_ga*MjAyMTk0MTcyNS4xNzA5NTc1NTE1*_ga_SGTY3SQ7MR*MTcxMjI0NTIzMC4xNS4xLjE3MTIyNDUyNTAuMC4wLjA.#section-individual-transects
).

Further, the Optical Model was most likely calibrated using chl a
concentrations; the Tampa Bay version of the Gallegos optical model is.

Future optical model work should examine light conditions in shallow areas of
the bay; including areas that have seagrass present and areas that potentially
may be suitable for seagrass growth.
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Marcus Beck
22:00 12. Apr.
 
Genehmiger
As in? Effects on circulation? Increased traffic/atmospheric nutrient
deposition?
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Neu
Jor Johansson
19:43 9. Apr.
 
Genehmiger
It should be noted that this management objective refers to the interpretation
of high altitude photographs with on-the-ground spot checks  collected every
other year by the SWFWMD; it is not developed from the on-the-ground annual
transect information discussed in this study plan.
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Ed Sherwood
17:29 3. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "and maintenance"
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Neu
Ed Sherwood
17:29 3. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "to peak coverages (≳11,100 acres)"
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Neu
Jor Johansson
20:34 4. Apr.
 
Genehmiger
which may indirectly
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Neu
Jor Johansson
20:51 4. Apr.
 
Genehmiger
Uprooting of seagrass is not limited to boating activities.  Such losses also
occur from bioturbation and grazing by various types of animals. 

Also, competition for space by other plants may limit seagrass distribution,
e.g. the extensive colonization of Caulerpa that has occurred recently in the
OTBCW and OTBN segments may hinder the recovery of seagrass in those areas.
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Neu
Ed Sherwood
17:52 3. Apr.
 
Genehmiger
References:
TBEP Tech. Pub.
07-04: https://drive.google.com/file/d/1-P4uYhVE2FaN5REMHolbM90G2Elsgzyb/view?usp=drivesdk
.

TBEP Tech. Pub.
03-07: https://drive.google.com/file/d/1HhPRLYQxNi0eP3-b_0x4C6W7VBjTpAhJ/view?usp=drivesdk
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Neu
sugandha shankar
10:54 13. Apr.
 
Genehmiger
Before suggesting these as possible shortcomings of current approach, there
should be a brief discussion (with references) that links low DO and sulfide
content to seagrass issues.
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Neu
Jor Johansson
21:19 4. Apr.
 
Genehmiger
Including internal loading
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Neu
Holly Greening
14:31 3. Apr.
 
Genehmiger
Reference
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Neu
Holly Greening
14:31 3. Apr.
 
Genehmiger
Reference
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Neu
sugandha shankar
21:29 12. Apr.
 
Genehmiger
Are there reliable estimates of regenerated N available in any literature? In my
opinion, this will be a tricky component to include for modeling purposes.
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sugandha shankar
21:30 12. Apr.

Genehmiger
Löschen: "augmentation and"
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Neu
Holly Greening
14:31 3. Apr.
 
Genehmiger
References
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Ed Sherwood
18:03 3. Apr.

Genehmiger
Jamaica Bay (NY) and Chesapeake Bay eutrophication model applications are
probably useful to reference here.
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1 Antwort
Neu
Jor Johansson
21:28 4. Apr.
 
Genehmiger
If the phytoplankton are a suitable food source
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sugandha shankar
10:59 13. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "abundance"
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sugandha shankar
10:59 13. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: ","
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sugandha shankar
10:59 13. Apr.

Genehmiger
Ersetzen: "and" durch "thus,"
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sugandha shankar
11:00 13. Apr.

Genehmiger
Ersetzen: "e" durch "l growth"
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Neu
Jor Johansson
21:35 4. Apr.
 
Genehmiger
Impacts by rays and manatees are known to be important.
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Ed Sherwood
18:07 3. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "in"
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Marcus Beck
22:15 12. Apr.

Genehmiger
Ersetzen: "is" durch "are"
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Ed Sherwood
18:09 3. Apr.

Genehmiger
Ersetzen: "MO" durch "OM"
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Gerold Morrison
15:01 8. Apr.
 
Genehmiger
Might want to add a paragraph at the end of this section addressing the
'subterranean estuary' as a potential source of water, nutrient and other fluxes
to the bay.  A couple of papers with data on Tampa Bay were published in 2007,
and Beebe et al. (2022) give an updated conceptual view of how those sorts of
data might be interpreted.
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Gerold Morrison
15:07 8. Apr.
 
Genehmiger
Might add a paragraph to the end of the WQ Modeling section addressing the issue
of 'identifiability'.  And the the
question of whether the right types (and quality) of data are available for
Tampa Bay to estimate desired parameter values
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Marcus Beck
22:21 12. Apr.

Genehmiger
Related, if identifiability is an issue (likely so), are there certain
parameters that are known with high certainty (i.e., exclude from calibration)
or others with high sensitivity (i.e., include for calibration)?
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Jor Johansson
20:24 5. Apr.
 
Genehmiger
including CDOM ?
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sugandha shankar
11:34 13. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "two"
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sugandha shankar
11:34 13. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "groups"
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Jor Johansson
20:36 5. Apr.
 
Genehmiger
Were any of these studies conducted during periods of Pb blooms, or during
blooms of similar dinoflagellate types.
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Gerold Morrison
20:46 5. Apr.
 
Genehmiger
The official name is the Environmental Protection Commission of Hillsborough
County. (Because it isn't a department under the County Administrator...
organizationally, it's a separate entity.)
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Marcus Beck
22:22 12. Apr.

Genehmiger
Löschen: "Hillsborough County"
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Marcus Beck
22:22 12. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "of Hillsborough County"
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Neu
sugandha shankar
11:43 13. Apr.
 
Genehmiger
dissolved or particulate?
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Neu
sugandha shankar
11:43 13. Apr.
 
Genehmiger
NH4 and NO3 fall under DIN so why is it listed again?
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Neu
Jor Johansson
20:43 5. Apr.
 
Genehmiger
How does the computed NTU values compare to the field measured NTU?
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Neu
Jor Johansson
20:48 5. Apr.
 
Genehmiger
Does it also include such accumulation from the Pb blooms?
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Neu
Gerold Morrison
20:58 5. Apr.
 
Genehmiger
Provide a reference for this definition of 'under-determined'?  It seems
different than the one I'm familiar with.
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Neu
Marcus Beck
22:24 12. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "(i.e., identifiability issues)"
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Neu
sugandha shankar
12:00 13. Apr.
 
Genehmiger
PUR?(include wavelength range)
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Neu
Jor Johansson
20:56 5. Apr.
 
Genehmiger
as chlorophyll a?
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Gerold Morrison
14:49 8. Apr.
 
Genehmiger
This is an important point... the underlying logic should be explained in more
detail, and references should be provided.
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Marcus Beck
22:28 12. Apr.

Genehmiger
Agreed, this is a good point. It's useful to propose more accurate comparisons
of modeled to observed data, e.g., an exact location (grid cell), depth, and
time that matches with EPC sampling.
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Holly Greening
14:31 3. Apr.
 
Genehmiger
If the RCA model will require the amount of reworking  described here,
abandonment may be the most appropriate option and should not be off the
table.  
The original approach of using empirical approaches coupled with a mechanistic
model for water quality-loading may warrant revisiting for addressing the water
quality endpoints.
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Marcus Beck
22:29 12. Apr.

Genehmiger
Or more lightweight mechanistic models, e.g., TB box model.
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1 Antwort
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Holly Greening
14:31 3. Apr.
 
Genehmiger
Will need to carefully assess whether this will be a fruitful exercise,
rather than using an alternative mechanistic model.
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Marcus Beck
22:30 12. Apr.

Genehmiger
Ersetzen: "Janicki Environmental Inc" durch "JEI"
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Marcus Beck
22:31 12. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: ", intercept of zero"
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Jor Johansson
17:35 8. Apr.
 
Genehmiger
Also see Johansson 2002; 2012; 2016 and Johansson and JEI 2022
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Jor Johansson
19:01 8. Apr.
 
Genehmiger
Are there any examples of studies elsewhere where a similar approach may have
been used?
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sugandha shankar
12:09 13. Apr.

Genehmiger
+1
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1 Antwort
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Holly Greening
14:32 3. Apr.
 
Genehmiger
Although important to understand the full ecological 'workings' of OTB, for this
time-constrained project it may be more important to focus on the immediate
needs for the RA-  i.e,  what impacts water quality (specifically chl-a
concentrations) since that is what FDEP will want to see.   The factors
affecting seagrass maintenance and growth are key management concerns also.
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Ed Sherwood
20:25 3. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "Environmental Favorability Functions ("
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Ed Sherwood
20:25 3. Apr.

Genehmiger
Ersetzen: "(" durch ","
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Ed Sherwood
20:28 3. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "ed"
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Maya Burke
18:25 3. Apr.
 
Genehmiger
This section mostly looks at multiple stressors through the lens of seagrasses,
but different stressors/tipping points may also be influencing
dino-cyano-macroalgae dynamics
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Gerold Morrison
23:15 3. Apr.

Genehmiger
Yes, and that links into the issue of OTB not meeting it's chl-a targets in many
recent years.
That needs to be discussed on a parallel track with the seagrass management
issue, since the two are different (though interrelated).
It would be helpful to add a subsection here discussing relationships between TN
loads and chl-a concentrations (and attainment of chl-a targets), before jumping
into the seagrass management discussion.
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Holly Greening
14:32 3. Apr.
 
Genehmiger
But the total N loading to OTB has not been reduced over time
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Jor Johansson
19:49 8. Apr.

Genehmiger
Yes, apparently not since the mid 1980s, but the large, mainly DIN, load
reductions that occurred during the late 1970s-early 1980s primarily in HB are
reflected in the TB chlorophyll-a record. Those reductions likely set the stage
for the increased seagrass growth in the upper bay sections.
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1 Antwort
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Gerold Morrison
22:47 3. Apr.
 
Genehmiger
I think Holly's point is an important one.  When you look at how the estimated
TN loads to the 4 major bay segments have changed over time (just the loads,
without the hydrologic adjustments), OTB really stands out as being 'different'
from the others.  
I put together a little summary, which Maya kindly uploaded to the shared drive
at
https://drive.google.com/file/d/1jecyw0U5a4POrwQhuiCvIL2b5PbbC_Gm/view?usp=drive_link
Hope it's helpful.
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Ed Sherwood
20:31 3. Apr.

Genehmiger
Ersetzen: "be of increasing importance in determining ecological production,
including" durch "also influence"
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Ed Sherwood
20:31 3. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "distribution and coverage"
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Holly Greening
22:29 8. Apr.
 
Genehmiger
Hi, Roger- Yes, totally agree that the TN loads were significantly reduced in
the mid-1980s- primarily due to WWTP upgrades.  But the point is that, since
1985 (when annual loading estimates began) the estimated TN load to OTB has not
shown additional reductions as in the other bay segments; the running average
trend line is considerably higher than the 'hold the line' TMDL; and in a number
of years, TN load is higher than the estimated 1976 'bad old days' load (see the
last slide in Gerold's summary).  Just another demonstration that OTB seems to
be functioning differently than the other bay segments.
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sugandha shankar
12:41 13. Apr.
 
Genehmiger
Summer blooms of P. bahamense
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Marcus Beck
22:40 12. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "Cyanobacteria blooms"
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Ed Sherwood
21:05 3. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "macro"
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Jor Johansson
18:33 8. Apr.
 
Genehmiger
Also by increasing temperature
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Jor Johansson
19:30 8. Apr.
 
Genehmiger
And has likely degrade further because of the extensive Pb blooms. There is no
basis to assume that these loadings have remained stable during the last decade.
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Marcus Beck
22:42 12. Apr.

Genehmiger
Ersetzen: "appears to have" durch "has"
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Marcus Beck
22:42 12. Apr.

Genehmiger
Löschen: "in the early going"
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Holly Greening
14:32 3. Apr.
 
Genehmiger
Really important to recognize that N loading has not been reduced. Suggest
clarifying this throughout this text.
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Maya Burke
18:42 3. Apr.

Genehmiger
to me, the rationale for retaining/tweaking the existing paradigm (versus
proposing something new altogether) rests on this point.
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Ed Sherwood
21:19 3. Apr.

Genehmiger
In simpler terms, does N loading above a certain rate still have a measurable,
detrimental effect on seagrass light availability in OTB -- as defined by the
original paradigm?

Johansson's (2022) recent analyses suggest light limitation may only be at play
in a few select subregions of OTB
- https://drive.google.com/file/d/1qaM852mkVkRyjwU8yZjlmZqMy1ROpcZi/view?usp=sharing
.

An N loading target specific to maintaining light conditions in those subregions
may still be applicable.
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Ed Sherwood
17:02 4. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "macro"
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Ed Sherwood
21:10 3. Apr.
 
Genehmiger
-- or long-term and sustained control of external  loads into the system.
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Marcus Beck
22:44 12. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "and environmentally harmful"
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Ed Sherwood
21:13 3. Apr.
 
Genehmiger
Some of the ancillary NEB assessments (and timelines for simulations) that
investigated 'reducing muck' accumulation in the OTB segment may be useful in
this context.
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Jor Johansson
20:04 8. Apr.
 
Genehmiger
If the recent internal loading has increased, and they likely have, as a result
of organic fallout from the extensive Pb blooms, then the impact from internal
loadings may be managed through reductions in Pb presence.
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Marcus Beck
22:48 12. Apr.
 
Genehmiger
Here and above, this implicitly suggests that alteration of the existing
paradigm to focus on spatially or temporally specific thresholds/targets is not
a viable option and/or simple elimination of hydrologically-normalized targets
could be effective.  In other words, abandoning rather than revising the
existing paradigm is implied.  I'm not suggesting a particular route, just that
it's useful to discuss other potential alternatives in more detail.
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sugandha shankar
11:34 14. Apr.

Genehmiger
The wording that other factors might be exerting greater influence seems far
reaching at this point. It could be result of multiple stressors together where
each stressor has a small influence or an indirect effect. While N loadings have
been managed, damage to the ecosystem has not been completely reverted. I think
there are multiple factors in play and it wouldn't be a matter of simply
managing some other environmental parameter at this point. The narrative here
and elsewhere sounds like contractors are in search for another environmental
variable that can be targeted the way nutrient loadings are targeted in
management. Like Marcus, I am also  not suggesting a particular route but I
think narrative should change some to reflect what is feasible in the project
timeline. 
1) I don't think in one year we can clearly identify another parameter that can
be managed like N loadings.
2) It most likely is an interplay of multiple stressors leading to poor
ecosystem health.
3) Modeling with stressors that can directly affect seagrass growth and
abundance will prove useful if you work with some chosen stressors based on
literature. So far narrative is lacking on references that back this
suggestion. 
4) Finally, I don't think it is a simple equation of decreasing/increasing one
variable to restore seagrass coverage (as is evident from the result of N
management). The team has recognized several stressors. A discussion that links
these stressors to seagrass health (directly or indirectly) before choosing a
route maybe helpful.
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sugandha shankar
11:44 14. Apr.

Genehmiger
These suggestions are not necessary for task 1 but I have listed here as I feel
these steps are important before team can decide how to revise/update current
paradigm. In other words, I think team should revisit the wording of this draft
and use slightly more cautious language.
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2 Antworten
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Jor Johansson
22:01 8. Apr.
 
Genehmiger
We already have that, see the TBEP transect db.
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Ed Sherwood
21:28 3. Apr.
 
Genehmiger
This is an interesting, alternative approach.
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Maya Burke
20:03 3. Apr.
 
Genehmiger
in the decision matrix flow chart, there might be a point at which, if we don't
see corresponding declines in chl-a in response to attainment of a modified TN
target, we may need to pursue actions that influence cellular loss of Pyro
(e.g., increase grazing from shellfish; decrease residence time with causeway
modifications)
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sugandha shankar
12:00 15. Apr.

Genehmiger
+1
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1 Antwort
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Ed Sherwood
21:33 3. Apr.
 
Genehmiger
(and potentially other, highly managed subbasins that may exert influence on an
endpoint of interest -- e.g. chl-a/pyro concentrations in western OTB)

See TBEP Tech. Pub.
14-15: https://drive.google.com/file/d/1ex-WEAjQ3tapL27H_lO0XOOTRXC037af/view

&

http://dx.doi.org/10.1016/j.ecss.2016.11.009
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Ed Sherwood
17:12 4. Apr.
 
Genehmiger
I like the process described in Fig. 5 and below with one exception -- it seems
to ignore residence time/circulation casual mechanisms that may also provide
alternative management interventions separate from hydrologic/nitrogen load
management.
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Miles Medina
20:55 10. Apr.

Genehmiger
@esherwood@tbep.org Yes, I think we need more discussion on this. The challenge
in some areas may be that there is not enough actual variation in
circulation/residence times to draw empirical inferences, and analyzing
counterfactuals could require modeling (Meyers). In this case, the empirical
work might be limited to taking the actual conditions that occurred (e.g., long
residence times in an area like Feather Sound) as given, to understand the
causal mechanisms at work under those actual conditions. On the other hand, if
we think there is sufficient variation in circulation/residence in an area of
interest, we could run causality tests using observed or simulated data (e.g.
some kind of aggregated values for velocity/direction or residence time)
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1 Antwort
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Maya Burke
18:32 3. Apr.
 
Genehmiger
or excessive chl-a exceedances?
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sugandha shankar
12:09 15. Apr.
 
Genehmiger
a positive result may also not necessarily indicate a cause-effect relationship.
I like this approach but again I feel, step c can be diving into literature to
better understand the results of CCM analyses.
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Miles Medina
18:44 21. Apr.

Genehmiger
@sugandha6@gmail.com  The CCM procedures include tests to screen out common
types of false positive results, and you are correct the interpretation of the
results requires careful consideration. Thanks --  I can add a couple sentences
to indicate these points
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1 Antwort
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Miles Medina
22:07 27. März
 
Genehmiger
this assessment will require an additional analysis during Task 3 -- how to
translate a reduction in the nitrogen concentration target into nitrogen load
reductions or a decision to hold partners to non-normalized allocations
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sugandha shankar
12:15 15. Apr.
 
Genehmiger
What about role of regenerated forms of N?
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0 Antworten
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Ed Sherwood
21:50 3. Apr.
 
Genehmiger
These assessments should consider the potential bio-availability (and sources)
of different N forms relative to our traditional TN targets.
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Jor Johansson
17:13 9. Apr.

Genehmiger
Yes, this is a very important point. Readily available forms of nitrogen (DIN)
need to receive more consideration in this analysis.
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Miles Medina
20:45 10. Apr.

Genehmiger
@esherwood@tbep.org I agree, and we can do that
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2 Antworten
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Ed Sherwood
21:48 3. Apr.
 
Genehmiger
I like this approach.
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Ed Sherwood
21:56 3. Apr.
 
Genehmiger
I fear this may be hampered by limited data availability along a tributary
reach, especially for smaller systems where only one, long-term monitoring
location may be established.

I'm not suggesting this investigation should be abandoned, however.
Interpretation of the results may be subject to the data limitations I expressed
above.
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Miles Medina
20:44 10. Apr.

Genehmiger
@esherwood@tbep.org Yes, we would likely encounter this data limitation along
some reach of interest, which could lead to a recommendation to establish new
monitoring locations and/or to pursue a targeted short-term study to help
resolve the pollution source(s) upstream of the uppermost monitoring location
(e.g. stable isotopes).
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1 Antwort
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Jor Johansson
17:15 9. Apr.
 
Genehmiger
Step 1. CDOM is also a seagrass stressor.
Step 3a. Can nitrogen loads be identified as DIN and DON?
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Jor Johansson
17:31 9. Apr.
 
Genehmiger
CDOM is missing
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Marcus Beck
16:57 14. Apr.
 
Genehmiger
Consider drawing a distinction between this figure and figure 2 - both are
conceptual diagrams but this one will form the basis of the empirical modeling. 
More specifically, how are the relationships different from those in Figure 2
(DAG)?  Does this model show only parameters with available data and/or can
incorporate unknown info?
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Miles Medina
01:17 17. Apr.

Genehmiger
@mbeck@tbep.org Yes, in a causal diagram for this purpose, you do want to
represent relevant unknown variables and variables that we don't have data for.
Unknown variables are represented as a "u" with a dotted-line circle around it.
The purpose is to properly account for potential confounding, even when we don't
know the exact mechanisms
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Marcus Beck
13:00 17. Apr.

Genehmiger
Thanks, makes sense.  I think the caption was just throwing me off.  Perhaps
state that this diagram is a representation of an empirical framework/DAG as the
basis for a quantitative analysis, separate from a general description of system
dynamics in Fig 2.
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2 Antworten
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sugandha shankar
12:27 15. Apr.
 
Genehmiger
Suggesting allelopathy will require additional laboratory studies. I don't think
there is much in literature about negative effect of saxitoxins on seagrass or
even other algae.
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Ed Sherwood
17:15 4. Apr.
 
Genehmiger
and algal production?
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Marcus Beck
16:59 14. Apr.

Genehmiger
Agreed, consider a similar framework that looks at chlorophyll/algal production
as an endpoint and how it might be used to evaluate the potential for different
or complementary endpoints for seagrass and chlorophyll (management and
regulatory distinction).
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Miles Medina
01:32 17. Apr.

Genehmiger
@esherwood@tbep.org @mbeck@tbep.org  Do you mean macroalgae or phytoplankton
here? For macroalgae, I imagine that data limitations would limit us to taking a
statistical approach, as described for seagrass in this paragraph. For
phytoplankton/chlorophyll, greater availability of data will allow us to choose
a statistical approach or a phase space approach, as described in the previous
paragraph.
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Marcus Beck
13:02 17. Apr.

Genehmiger
Referring to phytoplankton here as it relates to regulatory attainment under the
NMC/RA.
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3 Antworten
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Jor Johansson
17:41 9. Apr.
 
Genehmiger
Also see Johansson and JEI 2022
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Ed Sherwood
17:33 4. Apr.
 
Genehmiger
I believe the TBNMC (and TBEP) would also like to see that any alternative
conditions/targets identified through this approach provide a reasonable
expectation of attaining a desired end point -- or at least as Maya described
previously, provide a framework that if a desired end point doesn't result when
such conditions are met, then an adaptive process to re-assess/pursue an
alternative management target would occur.
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Jor Johansson
18:14 9. Apr.
 
Genehmiger
The seagrass restoration in problem areas of OTB has primarily consisted of
increased Hw abundance. Hw has a relatively low biomass and is known to respond
rapidly to changing conditions (e.g. see Morris and Virnstein 2004; and
transects information from HB). This ability by Hw should be considered if a new
reference period is considered; and such considerations might also include the
utility of using this species as a primary indicator of seagrass management
efforts.
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Jor Johansson
23:51 22. März
 
Genehmiger
Are the annual FO values corrected for common placements locations and transect
lengths between the years that are included in the graph?

Also, to make the comparison more meaningful I suggest limiting the Hw presence
to BB values >=2. This avoids including observations of minor presence and
focuses the analysis on substantial and likely functional seagrass presence.

It would be of interest to also limit the examination to the specific areas
where the large Hw losses have occurred, i.e. OTBN and OTBCW (see Johansson and
Janicki Inc. 2022).

Further, the above ground biomass of Hw varies seasonally; both blade density
and height are often substantially reduced in relatively shallow areas during
the cold season. Thus, visual observations of  abundance recorded during the
cold season may not reflect those that may have been present during a warmer
period.  I suggest that transect surveys conducted (if any) past the recommended
October/November survey time window be excluded in the analysis.

Also, conclusions drawn from this analysis should be balanced with the
recognition that variations in Hw abundance are affected by numerous factors in
addition to those that may be caused by nitrogen loading (see  Morris and
Virnstein 2004[Estuaries v27]; Johansson 2016 [TBEP 08-16]).
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Miles Medina
02:51 28. März

Genehmiger
@johanssonjor@gmail.com these are excellent points and I look forward to
discussing as we pursue this part of the analysis
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Brandon Johnson
01:27 29. März

Genehmiger
Regarding Roger's comment of limiting to areas where BB values are >2--I would
like to look at the seagrass data in greater detail but am initially hesitant
about applying a blanket criteria such as this as many areas of may have
persistent Hw occurrence at lower cover-abundance values. I look forward to
exploring this more however.
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Jor Johansson
20:04 1. Apr.

Genehmiger
Hi Brandon,
The graph below shows fractions of the seven abundance BB scores (Single SS
to 5) recorded for Halodule during transect sampling in OTB 20120-2020.
Segments are defined in the 2022 report (#6-22) to the TBEP. Perhaps this
information will be of some help.

[image: image.png]

My best,
Roger

J.O. Roger Johansson
johanssonjor@gmail.com <johanssonjor@gmail.com>
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Maya Burke
19:10 22. März
 
Genehmiger
From Coastwise: interested in the hydrologic regime for OTB, and that for every
year the hydrologic adjustment is needed since 201 except 2023. How do the other
bay segments do with the need for the adjustment? See Gerold's initial
assessment that OTB has only met the TMDL load occasionally, although the
hydrologic adjustment shows downward trend. We are pleased to see that the
STANTEC team is suggesting not using the hydrologic adjustment as an option.
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Ed Sherwood
22:47 3. Apr.
 
Genehmiger
This primarily relates to individual entity load allocation compliance, and not
necessarily how the bay segment wide TMDL is assessed through the TN delivery
ratio NNC.
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Ed Sherwood
22:56 3. Apr.
 
Genehmiger
See the TN Loading tab on this page, as this represents  the FDEP-adopted NNC
for the bay segments: https://tbep.org/estuary/state-of-the-bay/ .

Assessment and derivation of the TN Delivery Ratio is a distinctly different
process and calculation then the CAF (which uses an estimate of total hydrologic
load to a bay segment in the absence of final datasets to help individual
entity's with their annual permit reporting to FDEP).
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Ed Sherwood
23:02 3. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "is likely"
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Ed Sherwood
23:02 3. Apr.

Genehmiger
Ersetzen: "s" durch "ing"
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Ed Sherwood
23:29 3. Apr.
 
Genehmiger
Unfortunately, the opposite was also true during the increasing seagrass
coverage period from 2010 - 2016 (i.e. increasing non-point source loads and
decreasing normalized loads also occurred during this period).
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Ed Sherwood
23:31 3. Apr.
 
Genehmiger
The recommendation should follow an evaluation that warrants the change. I would
frame this section, as such.
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Marcus Beck
17:16 14. Apr.
 
Genehmiger
This description isn't entirely different from the following paragraph that
describes the logistic function.  To me, it's really more about the size of the
'safety factor', i.e., how big is Lmax (larger - more safety, smaller - less
safety, Lmax = Qref - complete abandonment).
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Ed Sherwood
17:42 4. Apr.
 
Genehmiger
Analytical approaches that can identify what this 'margin of safety' might be
given current (and potentially future) hydrologic regimes could be fairly simple
and straightforward given available datasets -- and might be the only thing
needed to justify and express an alternative N load assimilative capacity for
the OTB system (and/or subsegments therein).

Take a look at the deviation around the original TMDL target for OTB in the
graphs (Slide 7), @gerold.morrison@gmail.com produced here:
https://drive.google.com/file/d/1jecyw0U5a4POrwQhuiCvIL2b5PbbC_Gm/view?usp=drive_link
.
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Marcus Beck
17:20 14. Apr.
 
Genehmiger
Relevant to Ed's comment above about empirically determining the margin of
safety.  I'm curious how the earlier described analysis could inform this, and
if not, what are some additional methods that could help elucidate.  I think a
ballpark estimate would be good, but the actual number may be a management
decision informed by the analysis.
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Holly Greening
14:32 3. Apr.
 
Genehmiger
Include another section here summarizing the datasets to be included in the
required deliverables for Task 1.  The SMEs may have knowledge of additional
datasets if we know what is already included.  A simple table including data
type (i.e., water quality, loading, etc); source; time period; short list of
parameters to be included would be very informative.
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Marcus Beck
17:22 14. Apr.

Genehmiger
Working repository here: https://github.com/tbep-tech/otbasscap-data
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Holly Greening
14:33 3. Apr.
 
Genehmiger
Nice summary-
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Ed Sherwood
17:57 4. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "of"
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Ed Sherwood
18:00 4. Apr.
 
Genehmiger
specific non-point source discharges (based on the results from the
bullet above)?
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Ed Sherwood
18:04 4. Apr.
 
Genehmiger
It's still not clear to me how residence time/circulation effects might be
considered or evaluated as a confounding factor here.
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Marcus Beck
17:27 14. Apr.
 
Genehmiger
Add link to GitHub repo: https://github.com/tbep-tech/otbasscap-data
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Ed Sherwood
18:01 4. Apr.

Genehmiger
Hinzufügen: "/SWFWMD"
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sheri.huelster@stantec.com
17:38 28. März

Genehmiger
Hinzufügen: "Yates, K.K., Greening, Holly, and Morrison, Gerold, eds., 2011,
Integrating Science and Resource Man…"
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sheri.huelster@stantec.com
17:38 28. März

Genehmiger
this is the publication citation for the Morrison chapter
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Anonyme Krähe

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Dokumentenstruktur
Überschriften, die Sie dem Dokument hinzufügen, werden hier angezeigt.
 
Introduction
Review of Existing Paradigm, Framework, and Integrated Model
2.1 Nutrient Management Paradigm
2.2 Conceptual Ecological Framework
Water Quality, Water Column Dynamics and Chlorophyll
Light Availability
Seagrass distribution and abundance
Food Web Dynamics
Benthic Invertebrates
Fish
2.3 Integrated Model
Watershed Modeling
Hydrodynamic Modeling
Water Quality Modeling
Optical Model
Ecological Model
2.4 Multiple stressors and tipping points
2.5 Seagrass Model
Alternative Empirical Approaches and Paradigm
Empirical Investigations of Causality
Hysteresis and Adaptive Management Targets
Nitrogen Load Normalization
Summary
4.1 Summary of Proposed Revisions and Alternatives
References


Änderungen von




 
 
 
 


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