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SARP — code de sortie HTML pour R : Emmanuel CURIS, août 2010 — mai 2015.


PRÉPARATION ET RELECTURE DE L'ARTICLE

Date de création : jeu. 13 avril 2023 à 12:29:22.
Auteur  : Emmanuel CURIS .

Version de R utilisée : R version 4.0.2 (2020-06-22).
Génération de nombres aléatoires :
— générateur = Mersenne-Twister ;
— méthode pour obtenir une distribution gaussienne = Inversion ;
— racine utilisée : 1974872004.

▼


CHARGEMENT ET PRÉPARATION DES DONNÉES

▼


CHARGEMENT DES DONNÉES

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CHARGEMENT DES FICHIERS

Les variables sont en colonnes, les individus en lignes.
Au total, 4 fichiers doivent être chargés.
Les fichiers sont lus dans le dossier Données.

Fichier Nom Résumé dosages.2021-08-16_EC.csv Dosages Valeurs de 11 variables
[colonnes] lues pour 4620 individus [lignes]. patients.2021-08-16_EC.csv
Patients Valeurs de 27 variables [colonnes] lues pour 165 individus [lignes].
dosages_PF4.2022-04-07b_EC.csv PF4 Valeurs de 5 variables [colonnes] lues pour
180 individus [lignes]. tubes.2022-11-04_EC.csv Tubes Valeurs de 11 variables
[colonnes] lues pour 19 individus [lignes].
Certaines variables ne prennent qu'une seule valeur et sont donc inutiles : on
les élimine — variable concernée : Vide (valeur : Total).

Fichier : Données/délais_Rennes.2023-04-12_IG.csv.

Valeurs de 29 variables [colonnes] lues pour 20 individus [lignes].
Certaines variables ne prennent qu'une seule valeur et sont donc inutiles : on
les élimine — variables concernées : Lettre.du.centre (valeur : G), X.1
(valeur : NA), HNF.sodique..1.0. (valeur : 1), Protamine (valeur : NA),
Heure.de.réception (valeur : NA),
Type.de.tube..dosage.local.1...citrate...2...CTAD (valeur : 2).
Certaines variables ne prennent qu'une seule valeur quand elles ne sont pas
manquantes et sont donc inutiles : on les élimine — variable concernée :
CRP..mg.L. (valeur : 6,9).

▶


PRÉPARATION DES DONNÉES

▶


BASE DES PATIENTS

On construit un identifiant patient : lettre du centre et numéro concaténés —
variable Id.patient.

▶

PRÉPARATION DES VARIABLES QUALITATIVES

On convertit directement en variable qualitative les variables suivantes :
Centre, Id, Sexe.

Variables indicatrices : I.ECMO, I.COVID, I.HNF_Sodique. On les recode, avec Non
pour 0 et Oui pour 1.

Variable qualitative à 2 modalités : Type.tube. On la recode, avec le tableau de
correspondance ci-dessous.


Modalité Citrate CTAD Valeurs 1 2


Variable qualitative à 4 modalités : Groupe. On la recode, avec le tableau de
correspondance ci-dessous.


Modalité Post-CEC Réa. chir. Réa. med. + ECMO Autre Valeurs 1 2 3 4


▶

PRÉPARATION DES VARIABLES QUANTITATIVES

On convertit les délais exprimés en heure:minutes:secondes en délais horaires.
On convertit la date de prélèvement en date.

▶

PRÉPARATION DES VARIABLES COMPLÉMENTAIRES

On calcule la clairance de la créatinine du patient suivant la formule de
Cockroft et Gault (message de Virginie SIGURET du 4 août 2021). Variable
résultat : ClCr.CG.
• Calcul du DFG, méthode de Cockroft et Gault — formule :
DFGCG = (140 − Âge) Poids /(0,814 [Créat]P) × (0,85 si femme) (unités : Âge en
années, Poids en kg, [créat]P en μmol/L) ;


On calcule la clairance de la créatinine du patient suivant la formule CKD-Épi
en postulant que tous les patients sont caucasiens (message de Virginie SIGURET
du 4 août 2021). Variable résultat : ClCr.CKD_EPI.
• Calcul du DFG, méthode CKD-EPI — formule : DFGCKD-Epi =  (unités : Âge en
années, [créat]P en μmol/L) ;


▶


BASE DES DOSAGES DES ACTIVITÉS

On construit un identifiant patient : lettre du centre et numéro concaténés —
variable Id.patient.

▶

PRÉPARATION DES VARIABLES QUALITATIVES

On harmonise le nom des automates : les automates Stago STAR Max 2 sont codés
STAR et non STA.
On harmonise le nom des réactifs.

On construit le dictionnaire des automates.

Code Fabricant Référence Code figure ACLWerfenACL-TOP750ACL CSSysmexCS-5100 ou
CS-2500CS STARStagoSTAR Max ou STAR Max 2STAR


On construit le dictionnaire des réactifs.

Code Nom Code figure Berichrom heparinBerichrom heparinBerichrom heparin Biophen
heparin LRTBiophen heparin LRTBiophen heparin LRT HemosIL liquid anti-XaHemosIL
liquid anti-XaHemosIL liquid anti-Xa Innovance heparinInnovance heparinInnovance
heparin STA Liquid anti-XaSTA Liquid anti-XaSTA Liquid anti-Xa



▶

PRÉPARATION DES VARIABLES QUANTITATIVES

Attention ! 7 valeurs de dosage sont négatives ! Ces valeurs sont converties en
demi-limite de quantification (soit 0,05). Valeurs concernées : Patient D-1
[STA-hyph-LIL-Citrate-International-Oui] — Patient D-10
[STA-hyph-LIL-Citrate-International-Oui] — Patient E-10
[STA-hyph-LIL-Citrate-International-Oui] — Patient G-6
[STA-hyph-LIL-Citrate-International-Oui] — Patient H-20
[STA-hyph-LIL-Citrate-International-Oui] — Patient H-42
[STA-hyph-LIL-Citrate-International-Oui] — Patient H-42
[STA-hyph-LIL-CTAD-International-Oui].

▶

VARIABLES COMPLÉMENTAIRES

On construit un identifiant de la méthode de dosage, caractérisée par
l'automate, le réactif et la présence ou non de dextran — variable Méthode.
On transforme en log le résultat du dosage — variable Dosage.ln
Attention ! Certaines valeurs de dosage sont nulles ! Ces valeurs seront
considérées manquantes une fois transformées en logarithme. Valeurs concernées :
Patient C-10 [STA-hyph-LIL-Citrate-International-Oui] — Patient C-10
[STA-hyph-LIL-CTAD-International-Oui].

▶


BASE DES DOSAGES DU FACTEUR 4 PLAQUETTAIRE

La variable Groupe n'est pas correcte, on l'élimine (Virginie SIGURET,
discussion du 25 mai 2022).

▶

PRÉPARATION DES VARIABLES QUANTITATIVES

Certains prélèvements sont indiqués comme ictériques par la mention (ict)
adossée à la valeur. On l'indique (variable I.Ictérique) et on convertit en
nombre toutes les valeurs.
2 prélèvements ictériques indiqués dans la base.

▶

VARIABLES COMPLÉMENTAIRES

On calcule la différence et le rapport entre les dosages des deux tubes (dans le
sens Citrate − CTAD) — variables P.delta_F4P et P.delta_F4P
On transforme en log le résultat du dosage dans chaque tube —
variables P.F4P_citrate.ln et P.F4P_CTAD.ln —, ainsi que leur différence et leur
rapport.

▶

SÉLECTION DES PATIENTS

On élimine les patients indiqués exclus.
2 patients de la base des dosages du facteur 4 plaquettaire sont indiqués
exclus. Ces patients seront otés de la base.

On élimine les patients indiqués en bis.
2 patients de la base des dosages du facteur 4 plaquettaire sont indiqués en
bis. Ces patients seront otés de la base.

On construit un identifiant patient : lettre du centre et numéro concaténés —
variable Id.patient.

▶


BASE DES CARACTÉRISTIQUES DES TUBES

On construit un identifiant du modèle de tube (marque et référence) —
variable Modèle.
On construit une indicatrice de la série de tubes utilisée : pour les tubes
citrates, une seule série ; pour les tubes CTAD, dans trois centres, changement
de type de tube en cours de protocole.
On convertit l'utilisation du pneumatique en variable qualitative.

▶


FUSION DES BASES DE DONNÉES

▶

FUSION DE LA BASE CLINIQUE ET DES RÉSULTATS DES DOSAGES DU FACTEUR 4
PLAQUETTAIRE

Le même tube ayant été utilisé pour tous les dosages, le résultat du dosage du
facteur 4 plaquettaire est valable pour un patient, quelle que soit la méthode.
on le fusionne donc ici.

Attention ! 13 patients de la base des dosages du facteur 4 plaquettaire ne
figurent pas dans la base des patients. Identifiants : 11 ; 13 ; 16 ; F02 ;
F07 ; F08 ; F10 ; F15 ; G12 ; H04 ; H10 ; H26 ; H27.
Ces patients seront ôté avant la fusion des bases.

Attention ! 2 patients de la base des patients ne figurent pas dans la base des
dosages du facteur 4 plaquettaire. Identifiants : B12 ; B13.
Base initiale : 165 lignes et 31 colonnes.
Base finale : 165 lignes et 40 colonnes.

▶

VARIABLES COMPLÉMENTAIRES

On « normalise » les taux de facteur plaquettaire 4 en les divisant par le
nombre de plaquettes.
•  tube citraté, variable F4P_Citrate.Pq
•  tube CTAD, variable F4P_CTAD.Pq
•  différence entre les tubes, variable F4P_Delta.Pq (dans le sens citrate −
CTAD).

▶

FUSION DE LA BASE CLINIQUE ET DES RÉSULTATS DES DOSAGES D'ACTIVITÉ

On fusionne les deux bases de données pour bénéficier des informations sur les
patients…
Base initiale : 4620 lignes et 14 colonnes.
Base finale : 4620 lignes et 54 colonnes.

▶

FUSION DE LA BASE ET DES CARACTÉRISTIQUES DES TUBES

▶

FUSION DE LA BASE DES DOSAGES D'ACTIVITÉ ANTI-XA ET DES CARACTÉRISTIQUES DES
TUBES

On fusionne la base des dosages d'activité anti-Xa avec les informations sur les
caractéristiques des tubes…
On crée pour cela une indicatrice de période pour les centres qui ont changé de
tube en cours de protocole.
Base clinique initiale : 4620 lignes et 55 colonnes.
Base finale : 4620 lignes et 64 colonnes.

▶

FUSION DE LA BASE DES DOSAGES DU PF4 ET DES CARACTÉRISTIQUES DES TUBES

On fusionne la base des patients et dosages du facteur 4 plaquettaire avec les
informations sur les caractéristiques des tubes…
On crée pour cela une indicatrice de période pour les centres qui ont changé de
tube CTAD en cours de protocole.
Base des patients initiale : 165 lignes et 44 colonnes.
Base finale : 165 lignes et 63 colonnes.

▼


PRÉPARATION COMPLÉMENTAIRE DES DONNÉES


▼


SÉLECTION DES DONNÉES

Les analyses ne sont faites que sur les dosages réalisés en utilisant
l'étalonnage « constructeur ».
Base des dosages : 2310 dosages avec l'étalon international exclus de l'analyse.
Base fusionnée : 2310 dosages avec l'étalon international exclus de l'analyse.

▼


RÉSUMÉ DE L'ARTICLE

▶


CONTEXTE (BACKGROUND)

Ce paragraphe ne contient aucun résultat.

▶


OBJECTIFS (OBJECTIVES)

Ce paragraphe ne contient aucun résultat.

▼


PLAN EXPÉRIMENTAL (PATIENTS/METHODS)

Nombre de centres : 8.
Nombre de groupes de patients : 4.
Groupes de patients : Post-CEC, Réa. chir., Réa. med. + ECMO, Autre.

Groupe 1
Post-CEC Groupe 2
Réa. chir. Groupe 3
Réa. med. + ECMO Groupe 4
Autre Effectif 39 35 53 38

Nombre de méthodes : 7.
Nombre de réactifs sans dextran : 2 [STA Liquid anti-Xa, Berichrom heparin] (en
comptant le berichrom reconstitué sans dextran).





▼


RÉSULTATS (RESULTS)

Nombre de patients : 165.
Nombre de mesures obtenu — étalon constructeur : 2273.
Activité anti-Xa moyenne dans le groupe 1 : 0,32 UI/mL avec dextran vs
0,05 UI/mL sans dextran.
Interaction dextran/groupe : p < 0,0001.
Interaction tube/groupe : p = 0,0302.

▶


CONCLUSION

Ce paragraphe ne contient aucun résultat.

▼


ARTICLE PROPREMENT DIT

▼


INTRODUCTION

▶

PREMIER PARAGRAPHE

Ce paragraphe ne contient aucun résultat.

▶

DEUXIÈME PARAGRAPHE

Ce paragraphe ne contient aucun résultat.

▼

TROISIÈME PARAGRAPHE

Nombre de groupes de patients : 4.
Nombre de méthodes : 7.

▼


PATIENTS ET MÉTHODES

▼


PATIENTS

Nombre de centres : 8.
Centres : Bordeaux, Dijon, Lariboisière, Lille, Nancy, Necker, Rennes,
Versailles.
Date du premier prélèvement : 2001-01-13.
Date du dernier prélèvement : 2021-11-05.

Les patients doivent avoir plus de 18 ans. C'est bien le cas (âge minimal :
24 ans).

Nombre de groupes de patients : 4.
Groupes de patients : Post-CEC, Réa. chir., Réa. med. + ECMO, Autre.

▼


PRÉLÈVEMENTS (BLOOD COLLECTION, PROCESSING AND STORAGE)

Molarité des tubes citratés : 0,109 M.
Références des tubes BD : 363048 (Citrate), 364305 (Citrate), 367599 (CTAD).
Références des tubes Greiner : 454327 (Citrate), 474304 (CTAD), 454064 (CTAD).

▼


MESURE DE L'ACTIVITÉ ANTI-XA (ANTI-XA ASSESSMENT)

▼

PREMIER PARAGRAPHE

Nombre de méthodes : 7.
Méthodes :
— réactif STA Liquid anti-Xa avec automate STAR [sans dextran] ;
— réactif Biophen heparin LRT avec automate ACL [avec dextran] ;
— réactif Biophen heparin LRT avec automate STAR [avec dextran] ;
— réactif HemosIL liquid anti-Xa avec automate ACL [avec dextran] ;
— réactif Berichrom heparin avec automate CS [avec dextran] ;
— réactif Berichrom heparin avec automate CS [sans dextran] ;
— réactif Innovance heparin avec automate CS [avec dextran].

▶

DEUXIÈME PARAGRAPHE — ÉTALONNAGE PAR LE KIT INTERNATIONAL

Ce paragraphe ne contient aucun résultat.

▼

TROISIÈME PARAGRAPHE

Nombre de réactifs avec dextran : 4 [Biophen heparin LRT, HemosIL liquid
anti-Xa, Berichrom heparin, Innovance heparin]
Nombre de réactifs sans dextran : 2 [STA Liquid anti-Xa, Berichrom heparin] (en
comptant le berichrom reconstitué sans dextran).

▼

QUATRIÈME PARAGRAPHE

Nombre de centres de dosage : 5.
Centres ayant réalisé les dosages : Bordeaux, Lariboisière, Lille, Necker,
Rennes, Nancy.
Limite de quantification : 0,1 UI/mL (quelle que soit la méthode de dosage).
Les valeurs en dessous de la limite de quantification on été prises égales à la
moitié de cette limite — soit 0,05 UI/mL.

▼


ANALYSE STATISTIQUE

▼

PREMIER PARAGRAPHE

Version de R : 4.0.2.
Version de lme4 : 1.1.32.
Risque de 1re espèce (α) : 0,05 (soit 5 %).
Confiance des intervalles : 0,95 (soit 95 %).

▼


RÉSULTATS

▼


PATIENTS

Nombre de patients : 165 — dont 114 hommes et 51 femmes.
Répartition des patients par groupe (les âges sont exprimées en moyenne
[min ; max]) :

Groupe 1
Post-CEC Groupe 2
Réa. chir. Groupe 3
Réa. med. + ECMO Groupe 4
Autre Effectif 39 35 53 38 Âge (années) m = 66,67 ; me = 70 [24 ; 83]
m = 64,03 ; me = 66 [39 ; 81] m = 65,13 ; me = 68 [27 ; 85] m = 68,61 ; me =
69,5 [36 ; 98] Pourcentage de femmes 35,9 % 28,57 % 33,96 % 23,68 % Nombre de
patients avec ECMO 0 1 5 0

Valeur pour l'ECMO indisponible pour 123 patients.



▼


MESURE DES ACTIVITÉS ANTI-XA (ANTI-XA VALUES MEASURED WITH THE DIFFERENT
COMBINATIONS IN THE FOUR PATIENT GROUPS)

▼

PREMIER PARAGRAPHE

Ce paragraphe renvoie à la figure 01, au tableau 01 et au tableau 02.

21 échantillons centrifugés plus de 2 h après le prélèvement (soit 12,73 %).

Tubes centrifugés dans la 1re heure : 120 (soit 72,73 %).
Tubes centrifugés dans les 2 premières heures : 144 (soit 87,27 %).
Délais : de 0 min à 9,3 h ; délai médian : 0,55 h — quartiles : [0,2833 ; 1,2].

Nombre de mesures attendu : 165×7×2×2 = 4620 — soit 2310 par méthode
d'étalonnage.
Nombre de mesures obtenu (non manquantes) : 4546 — soit 74 dosages manquants.
Nombre de mesures obtenu — étalon constructeur : 2273 — soit 37 dosages
manquants.
Nombre de mesures obtenu — étalon international : 2273 — soit 37 dosages
manquants.
Lien entre méthode et mesure absente : p = 0,3111 (test exact de Fisher).

Méthode Berichrom heparin:Non:CS Berichrom heparin:Oui:CS Biophen heparin
LRT:Oui:ACL Biophen heparin LRT:Oui:STAR HemosIL liquid anti-Xa:Oui:ACL
Innovance heparin:Oui:CS STA Liquid anti-Xa:Non:STAR Dosage Manquant 5 5 3 8 9 5
2 37 Présent 325 325 327 322 321 325 328 2273 330 330 330 330 330 330 330 2310


Lien entre type de tube et mesure absente : p = 0,0072 (test exact de Fisher).

Méthode Citrate CTAD Dosage Manquant 10 27 37 Présent 1145 1128 2273 1155 1155
2310



▼

DEUXIÈME PARAGRAPHE

Ce paragraphe renvoie à la figure 01, à la figure 02 et au tableau 02.

Pourcentage de valeurs inférieures (ou égales) à la limite de quantification
(tous groupes et tubes confondus) : 41,5 % en l'absence de dextran — 15,31 % en
présence de dextran.
Pourcentage de valeurs inférieures (ou égales) à la limite de quantification
(tube citraté, tous groupes confondus) : 46,81 % en l'absence de dextran —
17,89 % en présence de dextran.
Pourcentage de valeurs inférieures (ou égales) à la limite de quantification
dans le groupe 1 (tube citraté) : 76,92 % en l'absence de dextran — 6,154 % en
présence de dextran.

▼


MODÉLISATION (MODELING THE EFFECT OF DEXTRAN SULFATE AND CTAD ON ANTI-XA LEVELS
(IU/ML))

Ce paragraphe renvoie au tableau 03.

Les comparaisons entre modèles pour simplifier le modèle complet sont faites par
modèles emboîtés (loi asymptotique du khi-deux) toujours par rapport au modèle
complet.
Sont aussi donnés l'AIC (qui doit être minimal), le BIC (qui doit être minimal),
et la ln-vraisemblance de chaque modèle (qui doit être maximale).
Modèle complet : AIC = 2663 — BIC = 2766 — ln V = −1313.
Interaction triple : AIC = 2661 — BIC = 2747 — ln V = −1316 — p = 0,2229.
Interaction dextran-groupe : AIC = 3221 — BIC = 3290 — ln V = −1598 — p <
0,0001.
Interaction tube-groupe : AIC = 2664 — BIC = 2733 — ln V = −1320 — p = 0,0380.
Interaction tube-dextran : AIC = 2663 — BIC = 2743 — ln V = −1317 — p = 0,0904.
Interaction tube-groupe (après avoir ôté l'interaction tube-dextran) :
AIC = 2666 — BIC = 2729 — ln V = −1322 — p = 0,0176.
Interaction dextran-groupe (après avoir ôté l'interaction tube-dextran) :
AIC = 3221 — BIC = 3284 — ln V = −1600 — p < 0,0001.
Effet du tube : AIC = 2739 — BIC = 2796 — ln V = −1360 — p < 0,0001.
Conclusion : on garde le modèle avec les effets du type de tube (citrate ou
CTAD), du dextran (présence ou absence) et du groupe (quatre groupes) et la
seule interaction entre le groupe et la présence de dextran.

Groupe de référence : Post-CEC.
Tube de référence : Citrate.
Référence pour le dextran : Non.
Le modèle s'écrit
ln Ai, j, t = µ0 + Uj + δDextran 1Dextran(i) + δCTAD 1CTAD(t) + Σk = 23 δGroupe k 1Groupe k(j) + Σk = 23 δDextran:k 1Dextran(t) 1Groupe k(j) + Σk = 23 δCTAD:k 1CTAD(t) 1Groupe k(j) + εi, j
où Ai, j, t est l'activité anti-Xa mesurée par la technique i chez le patient j
avec un tube de type t.

Effet du dextran (tube citraté)
Dans le groupe 1 : +296 % (IC à 95 % : [257,7 ; 338,4]).
Dans le groupe 4 : +30,23 % (IC à 95 % : [17,4 ; 44,46]).
Effet du CTAD
Dans le groupe 1 : +7,87 % (IC à 95 % : [−1,598 ; 18,25]).
Dans le groupe 2 : +23,92 % (IC à 95 % : [12,47 ; 36,54]).

▼


DISCUSSION

▼

PREMIER PARAGRAPHE

Nombre de méthodes de dosage : 7.
Nombre de patients : 165.
Effet du CTAD : +7,87 %.

▶

DEUXIÈME PARAGRAPHE

Ce paragraphe ne contient aucun résultat.

▼

TROISIÈME PARAGRAPHE

Pourcentage de valeurs inférieures (ou égales) à la limite de quantification
dans le groupe 1 (tube citraté) : 76,92 % en l'absence de dextran — 6,154 % en
présence de dextran.

▼

QUATRIÈME PARAGRAPHE

Effet du dextran dans le groupe 3 : +53,31 %.
Médiane de l'activité (tube citraté) : 0,22 UI/mL sans dextran et 0,305 UI/mL
avec dextran.

▶

CINQUIÈME PARAGRAPHE

Ce paragraphe ne contient aucun résultat.

▼

SIXIÈME PARAGRAPHE

Effet du CTAD : +7,87 % (quel que soit le tube, CTAD ou citraté).

▶

SEPTIÈME PARAGRAPHE

Ce paragraphe ne contient aucun résultat.

▶

HUITIÈME PARAGRAPHE

Ce paragraphe ne contient aucun résultat.

▶


CONCLUSION

Ce paragraphe ne contient aucun résultat.

▼


TABLEAUX POUR L'ARTICLE

▼


TABLEAU 1 — RÉSULTATS OBTENUS

HemosIL liquid anti-Xa.Oui.ACL Biophen heparin LRT.Oui.ACL Biophen heparin
LRT.Oui.STAR Innovance heparin.Oui.CS Berichrom heparin.Oui.CS Berichrom
heparin.Non.CS STA Liquid anti-Xa.Non.STAR Dextran Oui Oui Oui Oui Oui Non Non
Automate ACL ACL STAR CS CS CS STAR Dosages réalisés avec l'étalon associé au
kit Citrate n 162 164 162 164 164 164 165 Médiane (UI/mL) 0,315 0,3 0,275 0,23
0,25 0,15 0,05 min – max (UI/mL) 0,05 – 1,76 0,05 – 2,6 0,09 – 1,89 0,05 – 1,5
0,05 – 2,16 0,05 – 1,84 0,03 – 1,75 < 0,1 UI/mL (n) 27 (16,67 %) 23 (14,02 %) 33
(20,37 %) 32 (19,51 %) 31 (18,9 %) 67 (40,85 %) 87 (52,73 %) CTAD n 159 163 160
161 161 161 163 Médiane (UI/mL) 0,36 0,35 0,34 0,29 0,27 0,2 0,13 min – max
(UI/mL) 0,02 – 1,71 0,05 – 2,68 0,09 – 1,81 0,05 – 1,45 0,05 – 2,02 0,05 – 1,8
0,05 – 1,84 < 0,1 UI/mL (n) 18 (11,32 %) 14 (8,589 %) 22 (13,75 %) 21 (13,04 %)
27 (16,77 %) 46 (28,57 %) 71 (43,56 %) Dosages réalisés avec l'étalon
international Citrate n 162 164 162 164 164 164 165 Médiane (UI/mL) 0,24 0,28
0,237864231791342 0,245 0,25 0,08 0,104103528092195 min – max (UI/mL) 0,05 –
1,59 0,05 – 2,64 0 – 1,64399208227234 0,05 – 1,66 0,05 – 2,1 0,05 – 1,5
0,0160664078690125 – 1,83592655466699 < 0,1 UI/mL (n) 40 (24,69 %) 32 (19,51 %)
40 (24,69 %) 30 (18,29 %) 30 (18,29 %) 87 (53,05 %) 82 (49,7 %) CTAD n 159 163
160 161 161 161 163 Médiane (UI/mL) 0,29 0,33 0,295591464071733 0,32 0,27 0,12
0,141596533730918 min – max (UI/mL) 0,02 – 1,71 0,05 – 2,68 0,09 – 1,81 0,05 –
1,45 0,05 – 2,02 0,05 – 1,8 0,05 – 1,84 < 0,1 UI/mL (n) 30 (18,87 %) 20
(12,27 %) 23 (14,38 %) 21 (13,04 %) 27 (16,77 %) 71 (44,1 %) 66 (40,49 %)

▼


TABLEAU 2 — CARACTÉRISTIQUES DES PATIENTS

Post-CEC Réa. chir. Réa. med. + ECMO Autre Tout Statistiques descriptives Âge
n = 39
70
[24 ; 83] n = 35
66
[39 ; 81] n = 53
68
[27 ; 85] n = 38
69,5
[36 ; 98] n = 165
69
[24 ; 98] Sexe

FM Total 14 25 39

FM Total 10 25 35

FM Total 18 35 53

FM Total 9 29 38

FM Total 51 114 165

Dosages réalisés avec l'étalon associé au kit Sans dextran, citrate n = 78 dont
60 < LOQ (soit 76,92 %)
0,05
[0,05 ; 1,62] n = 70 dont 45 < LOQ (soit 64,29 %)
0,05
[0,05 ; 0,35] n = 105 dont 29 < LOQ (soit 27,62 %)
0,22
[0,05 ; 1,84] n = 76 dont 20 < LOQ (soit 26,32 %)
0,47
[0,05 ; 1,75] n = 329
0,12
[0,05 ; 1,84] Sans dextran, CTAD n = 78 dont 57 < LOQ (soit 73,08 %)
0,05
[0,05 ; 1,46] n = 70 dont 30 < LOQ (soit 42,86 %)
0,12
[0,05 ; 0,42] n = 102 dont 17 < LOQ (soit 16,67 %)
0,26
[0,05 ; 1,8] n = 74 dont 13 < LOQ (soit 17,57 %)
0,555
[0,05 ; 1,84] n = 324
0,17
[0,05 ; 1,84] Avec dextran, citrate n = 195 dont 12 < LOQ (soit 6,154 %)
0,32
[0,05 ; 1,6] n = 175 dont 88 < LOQ (soit 50,29 %)
0,05
[0,05 ; 0,71] n = 256 dont 19 < LOQ (soit 7,422 %)
0,305
[0,05 ; 2,6] n = 190 dont 27 < LOQ (soit 14,21 %)
0,55
[0,05 ; 2,16] n = 816
0,28
[0,05 ; 2,6] Avec dextran, CTAD n = 195 dont 7 < LOQ (soit 3,59 %)
0,34
[0,05 ; 1,52] n = 175 dont 58 < LOQ (soit 33,14 %)
0,13
[0,05 ; 0,67] n = 249 dont 13 < LOQ (soit 5,221 %)
0,34
[0,05 ; 2,68] n = 185 dont 24 < LOQ (soit 12,97 %)
0,59
[0,05 ; 2,12] n = 804
0,32
[0,05 ; 2,68] Dosages réalisés avec l'étalon international Sans dextran, citrate
n = 78 dont 60 < LOQ (soit 76,92 %)
0,05
[0,05 ; 1,697] n = 70 dont 55 < LOQ (soit 78,57 %)
0,05
[0,05 ; 0,3354] n = 105 dont 33 < LOQ (soit 31,43 %)
0,18
[0,05 ; 1,825] n = 76 dont 21 < LOQ (soit 27,63 %)
0,3837
[0,05 ; 1,836] n = 329
0,05
[0,05 ; 1,836] Sans dextran, CTAD n = 78 dont 57 < LOQ (soit 73,08 %)
0,05
[0,05 ; 1,532] n = 70 dont 44 < LOQ (soit 62,86 %)
0,05
[0,05 ; 0,3818] n = 102 dont 22 < LOQ (soit 21,57 %)
0,2146
[0,05 ; 1,66] n = 74 dont 14 < LOQ (soit 18,92 %)
0,5
[0,05 ; 1,927] n = 324
0,1387
[0,05 ; 1,927] Avec dextran, citrate n = 195 dont 21 < LOQ (soit 10,77 %)
0,3
[0,05 ; 1,52] n = 175 dont 98 < LOQ (soit 56 %)
0,05
[0,05 ; 0,72] n = 256 dont 25 < LOQ (soit 9,766 %)
0,29
[0,05 ; 2,64] n = 190 dont 28 < LOQ (soit 14,74 %)
0,5227
[0,05 ; 2,12] n = 816
0,25
[0,05 ; 2,64] Avec dextran, CTAD n = 195 dont 8 < LOQ (soit 4,103 %)
0,32
[0,05 ; 1,48] n = 175 dont 72 < LOQ (soit 41,14 %)
0,12
[0,05 ; 0,68] n = 249 dont 17 < LOQ (soit 6,827 %)
0,317
[0,05 ; 2,68] n = 185 dont 24 < LOQ (soit 12,97 %)
0,56
[0,05 ; 2,12] n = 804
0,3
[0,05 ; 2,68]

▼


TABLEAU 3 — RÉSULTATS DU MODÈLE

Le modèle complet, ajusté au logarithme des activités anti-Xa, intègre les
prédicteurs suivants :
— le groupe de patients ;
— le type de tube (citrate ou CTAD, référence : citrate) ;
— la présence de Dextran (référence : absence de Dextran) ;
— l'interaction entre le type de tube et la présence de Dextran ;
— l'interaction entre le groupe et la présence de Dextran ;
— l'interaction entre le groupe et le type de tube ;
— l'interaction triple entre le groupe, le type de tube et la présence de
Dextran ;
— un effet aléatoire « Patient » (supposé gaussien et indépendant de l'erreur
résiduel).

▼


DOSAGES RÉALISÉS AVEC L'ÉTALON ASSOCIÉ AU KIT

Ce modèle permet de déduire qu'il n'y a pas d'interaction triple (p = 0,2229),
et pas d'interaction entre le type de tube et la présence de dextran
(p = 0,0904 ; en revanche, il existe une interaction entre le groupe et le type
de tube (p = 0,0380) test asymptotique global des modèles emboîtés). —
globalement, p = 0,0904 ; Les résultats sont donc données à partir du modèle
simplifié omettant ces termes.

▼

COEFFICIENTS DU MODÈLE

L'ordonnée à l'origine correspond à la valeur dans le groupe de référence
(Post-CEC) pour un tube citrate sans dextran.


Terme Échelle ln Échelle originale δ I. C. à 95 % eδ I. C. à 95 % Ordonnée à
l'origine µ0 = −2,561 [−2,787 ; −2,335] 0,07721 [0,06158 ; 0,09682] Variation
due au groupe (tube citrate, sans dextran) Groupe Réa. chir. 0,0756
[−0,2534 ; 0,4046] 7,853 % [−22,38 ; 49,87] Groupe Réa. med. + ECMO 0,884
[0,5858 ; 1,182] 142,1 % [79,64 ; 226,1] Groupe Autre 1,288 [0,9662 ; 1,61]
262,7 % [162,8 ; 400,5] Effet du tube (groupe 1, avec et sans dextran) CTAD
0,07576 [0,01269 ; 0,1388] 1,079 [1,013 ; 1,149] Effet du dextran (groupe 1,
quel que soit le tube) Dextran 1,376 [1,306 ; 1,446] 3,96 [3,693 ; 4,246] Effet
additionnel du dextran dans les autres groupes (quel que soit le tube) Dextran,
groupe Réa. chir. −1,056 [−1,157 ; −0,954] −65,2 % [−68,56 ; −61,48] Dextran,
groupe Réa. med. + ECMO −0,9489 [−1,042 ; −0,8563] −61,28 % [−64,71 ; −57,53]
Dextran, groupe Autre −1,112 [−1,212 ; −1,012] −67,11 % [−70,23 ; −63,66] Effet
additionnel du CTAD dans les autres groupes (avec ou sans dextran) CTAD,
groupe Réa. chir. 0,1387 [0,04699 ; 0,2304] 14,88 % [4,811 ; 25,91] CTAD,
groupe Réa. med. + ECMO 0,0539 [−0,03013 ; 0,1379] 5,538 % [−2,968 ; 14,79]
CTAD, groupe Autre 0,06964 [−0,02064 ; 0,1599] 7,212 % [−2,043 ; 17,34]



▼

PRÉSENTATION DES RÉSULTATS DU MODÈLE

L'effet du dextran étant différent d'un groupe à l'autre (interaction
significative, p < 0,0001), les résultats du modèle sont présentés pour chaque
groupe séparément pour clarifier l'interprétation.
Les intervalles de confiance sont ici donnés après correction de multiplicité
(approximation d'une loi gaussienne multidimensionnelle).
Toutes les valeurs sont données dans l'échelle des activités anti-Xa (UI/mL).


Facteur Post-CEC Réa. chir. Réa. med. + ECMO Autre Basal 0,07721 (IC :
[0,05562 ; 0,1072]) 0,08328 (IC : [0,0589 ; 0,1177]) 0,1869 (IC :
[0,141 ; 0,2477]) 0,28 (IC : [0,2008 ; 0,3905]) CTAD +7,87 % (IC :
[−1,598 ; 18,25]) +23,92 % (IC : [12,47 ; 36,54]) +13,84 % (IC :
[4,998 ; 23,44]) +15,65 % (IC : [5,265 ; 27,06]) Dextran +296 % (IC :
[257,7 ; 338,4]) +37,8 % (IC : [23,78 ; 53,42]) +53,31 % (IC : [40,3 ; 67,51])
+30,23 % (IC : [17,4 ; 44,46])



▶


DOSAGES RÉALISÉS AVEC L'ÉTALON INTERNATIONAL

Ce modèle permet de déduire qu'il n'y a pas d'interaction triple (p = 0,3830),
pas d'interaction entre le type de tube et la présence de dextran (p = 0,2881),
et pas d'interaction entre le groupe et le type de tube (p = 0,1443). En
revanche, il existe une interaction entre le groupe et la présence de dextran
(p < 0,0001), — globalement, p = 0,1190 ; tous les tests sont des tests
asymptotiques des modèles emboîtés. Les résultats sont donc données à partir du
modèle simplifié omettant ces termes.

▼

COEFFICIENTS DU MODÈLE


▼

COEFFICIENTS DU MODÈLE

L'ordonnée à l'origine correspond à la valeur dans le groupe de référence
(Post-CEC) pour un tube citrate sans dextran.


Terme Échelle ln Échelle originale δ I. C. à 95 % eδ I. C. à 95 % Ordonnée à
l'origine µ0 = −2,604 [−2,837 ; −2,372] 0,07394 [0,0586 ; 0,09331] Variation due
au groupe (tube citrate, sans dextran) Groupe Réa. chir. 0,02314
[−0,3143 ; 0,3606] 2,341 % [−26,97 ; 43,41] Groupe Réa. med. + ECMO 0,8128
[0,5069 ; 1,119] 125,4 % [66,02 ; 206,1] Groupe Autre 1,246 [0,9157 ; 1,577]
247,7 % [149,9 ; 383,8] Effet du tube (tous les groupes, avec et sans dextran)
CTAD 0,1492 [0,1172 ; 0,1811] 1,161 [1,124 ; 1,199] Effet du dextran (groupes de
référence, quel que soit le tube) Dextran 1,304 [1,232 ; 1,376] 3,684
[3,428 ; 3,958] Effet additionnel du dextran dans les autres groupes (quel que
soit le tube) Dextran, groupe Réa. chir. −1,037 [−1,142 ; −0,9327] −64,55 %
[−68,07 ; −60,65] Dextran, groupe Réa. med. + ECMO −0,8513 [−0,9467 ; −0,756]
−57,31 % [−61,2 ; −53,04] Dextran, groupe Autre −1,037 [−1,14 ; −0,9343]
−64,55 % [−68 ; −60,71]



▼

PRÉSENTATION DES RÉSULTATS DU MODÈLE

L'effet du dextran étant différent d'un groupe à l'autre (interaction
significative, p < 0,0001), les résultats du modèle sont présentés pour chaque
groupe séparément pour clarifier l'interprétation.
Les intervalles de confiance sont ici donnés après correction de multiplicité
(approximation d'une loi gaussienne multidimensionnelle).
Toutes les valeurs sont données dans l'échelle originelle.


Facteur Post-CEC Réa. chir. Réa. med. + ECMO Autre Basal 0,07394 (IC :
[0,05315 ; 0,1029]) 0,07567 (IC : [0,05341 ; 0,1072]) 0,1667 (IC :
[0,1255 ; 0,2213]) 0,2571 (IC : [0,184 ; 0,3592]) CTAD +16,09 % (IC :
[10,97 ; 21,44]) Dextran +268,4 % (IC : [232,8 ; 307,7]) +30,57 % (IC :
[17,32 ; 45,32]) +57,24 % (IC : [43,93 ; 71,78]) +30,6 % (IC : [17,77 ; 44,83])



▼


FIGURES POUR L'ARTICLE

▼


FIGURE 1 — VUE D'ENSEMBLE DES RÉSULTATS

La figure est faite uniquement pour l'étalon du kit. L'équivalent avec l'étalon
international n'est pas représenté.
Code couleur & symbole : en fonction du groupe — disque rouge : groupe 1 ;
triangle vert : groupe 2 ; cercle bleu : groupe 3 ; astérisque orange :
groupe 4.
Les boîtes à moustaches et blocs de valeurs indétectables sont en noir pour le
tube citraté et en jaune pour le tube CTAD.
La limite de détection est le trait horizontal orange.
Nombre de valeurs indétectables (étalon constructeur) : 519.


▼


FIGURE 2 — RÉSULTATS POUR LE BERICHROM

La figure est faite uniquement pour le tube citraté, étalon du kit. L'équivalent
pour le tube CTAD est dans les figures additionnelles. Les équivalents avec
l'étalon international ne sont pas représentés.
Le code couleur des groupes est le même que pour la figure 1.
1 dosage manquant aussi bien avec que sans dextran.


▼


FIGURE 3 — COMPARAISON DES MÉTHODES AVEC ET SANS DEXTRAN

La figure est faite uniquement pour le tube citraté, étalon du kit. L'équivalent
pour le tube CTAD est dans les figures additionnelles. Les équivalents avec
l'étalon international ne sont pas représentés.
Le code couleur des groupes est le même que pour la figure 1.


▼


INFORMATIONS ADDITIONNELLES

▼


FIGURES ADDITIONNELLES

▼


FIGURE S-1 — COMPARAISONS DEUX À DEUX DES MÉTHODES (TUBE CITRATÉ)


▼


FIGURE S-2 — COMPARAISONS DES MÉTHODES AVEC ET SANS DEXTRAN (TUBE CTAD)


▼


FIGURE S-3 — COMPARAISONS DEUX À DEUX DES MÉTHODES (TUBE CTAD)


▼


FIGURES INUTILISÉES

▼


COMPARAISONS ENTRE L'ÉTALON DU KIT ET L'ÉTALON INTERNATIONAL

▼

ENSEMBLE DES RÉSULTATS...

Étalon du kit Étalon international

▼

BERICHROM AVEC OU SANS DEXTRAN, PAR GROUPE

Tube Citrate Tube CTAD Dosages réalisés avec l'étalon associé au kit 1 dosage
manquant aussi bien avec que sans dextran.
4 dosages manquants aussi bien avec que sans dextran.
Dosages réalisés avec l'étalon international 1 dosage manquant aussi bien avec
que sans dextran.
4 dosages manquants aussi bien avec que sans dextran.


▼

COMPARAISON DES MÉTHODES AVEC DEXTRAN AUX MÉTHODES SANS DEXTRAN

Tube Citrate Tube CTAD

▼

COMPARAISON DES MÉTHODES AVEC DEXTRAN ENTRE ELLES ET DES MÉTHODES SANS DEXTRAN
ENTRE ELLES

Tube Citrate Tube CTAD

▼


COMPARAISONS DES TUBES CTAD ET CITRATES POUR CHAQUE MÉTHODE

Étalon du kit Étalon international

▼


COMPLÉMENTS POUR RÉPONDRE AUX DEMANDES DES RAPPORTEURS

▼


DEMANDES DU RAPPORTEUR 3

Comparaison (graphique) des valeurs avec et sans dextran pour voir un éventuel
effet dextran variant avec l'activité anti-Xa.

Tube citraté Tube CTAD Résultat des étalonnages constructeurs Résultat de
l'étalonnage international



▼


DEMANDES DU RAPPORTEUR 4

▼


COMPARAISON DES TUBES CITRATE ET CTAD

Pour chacune des méthodes, on compare les résultats du tube citraté (en
abscisse) et du tube CTAD (en ordonnée). La droite bleue est la droite de
Passing-Bablok, dont l'équation est donnée en bas, à droite. Les codes pour les
points sont ceux des figures précédentes.


Étalon du kit Étalon international



▼


RÉSULTATS DU MODÈLE EN ÔTANT LE PREMIER GROUPE

On recommence l'analyse sans prendre en compte les résultats obtenus dans le
premier groupe (Post-CEC).
Modèle complet : AIC = 1935 — BIC = 2011 — ln V = −953,4.
Interaction triple : AIC = 1933 — BIC = 1998 — ln V = −954,3 — p = 0,3888.
Interaction tube-dextran : AIC = 1937 — BIC = 1997 — ln V = −957,5 — p = 0,0403.
Interaction tube-groupe : AIC = 1933 — BIC = 1987 — ln V = −956,4 — p = 0,1924.
Interaction dextran-groupe : AIC = 1942 — BIC = 1996 — ln V = −960,9 —
p = 0,0047.
Effet du tube : AIC = 1933 — BIC = 1987 — ln V = −956,4 — p = 0,1924.
Conclusion : on garde le modèle avec les effets du type de tube (citrate ou
CTAD), du dextran (présence ou absence) et du groupe (quatre groupes) mais aussi
l'interaction entre le groupe et la présence de dextran et l'interaction entre
le type de tube et la présence de dextran.

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Contact pour plus d'infos ou de l'aide sur SARP : Emmanuel CURIS Dernière
modification : jeudi 13 février 2017, 13 h 54